Chaque Église de Scientologie a ses propres statuts et son conseil d’administration. Les cadres et les directeurs forment aussi la direction ecclésiastique de l’Église. Ils sont entièrement responsables de l’administration des services à leurs paroissiens.
L’Église de Scientologie internationale (Church of Scientology International - CSI), Église mère de la religion de Scientologie, a son siège à Los Angeles. L’Église mère assure la direction ecclésiastique de toutes les Églises, organisations et de tous les groupes de Scientologie dans le monde. Elle veille à ce que les Églises soient guidées dans leur ministère. Elle élabore aussi les plans et les orientations générales destinés à soutenir la croissance internationale de l’Église.
